Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc4a8Q8JZR6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms