Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms