Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LgsnQ8CIX8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms