Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trpm6Q8CIR4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm6Q8CIR4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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