Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfwd3Q8CIK8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfwd3Q8CIK8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms