Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SltmQ8CH25 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SltmQ8CH25 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms