Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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