Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd1bQ8CFT2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms