Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms