Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc9Q8CDN9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms