Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin52Q8CD94 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin52Q8CD94 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms