Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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