Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd4aQ8CBY1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd4aQ8CBY1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms