Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms