Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrn3Q8CBC6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms