Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc159Q8C963 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc159Q8C963 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms