Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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