Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms