Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms