Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Larp4Q8BWW4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms