Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Triml1Q8BVP1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Triml1Q8BVP1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms