Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BP99 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BP99 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BP99 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BP99 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BP99 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BP99 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 757.7 ms