Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik4Q8BMF5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms