Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms