Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms