Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tubgcp5Q8BKN5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp5Q8BKN5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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