Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy1Q8BIJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms