Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms