Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8BGC1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms