Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trmt12Q8BG71 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms