Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cpped1Q8BFS6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cpped1Q8BFS6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cpped1Q8BFS6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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