Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.2Q85ZW9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.2Q85ZW9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.2Q85ZW9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.2Q85ZW9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms