Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfascQ810U3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms