Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ChfrQ810L3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms