Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim50Q810I2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim50Q810I2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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