Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Smim19Q80ZU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Smim19Q80ZU4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Smim19Q80ZU4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Smim19Q80ZU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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