Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b3Q80ZS5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn34b3Q80ZS5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn34b3Q80ZS5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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