Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NanogQ80Z64 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NanogQ80Z64 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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