Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5bQ80Y84 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5bQ80Y84 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms