Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pcsk9Q80W65 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pcsk9Q80W65 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pcsk9Q80W65 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pcsk9Q80W65 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pcsk9Q80W65 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms