Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf4Q80VU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms