Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Avl9Q80U56 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms