Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NischQ80TM9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
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