Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf516Q7TSH3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf516Q7TSH3 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf516Q7TSH3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf516Q7TSH3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf516Q7TSH3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms