Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf18Q7TS55 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms