Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrc2bQ7TPM1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms