Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HhipQ7TN16 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HhipQ7TN16 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms