Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms