Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trappc6aQ78XR0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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