Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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